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酯功能化的雙子表面活性劑與血紅蛋白的結(jié)合——結(jié)果和討論

來源:上海謂載 瀏覽 1258 次 發(fā)布時(shí)間:2021-11-15


三、結(jié)果和討論


3.1. 表面張力測(cè)量


表面張力測(cè)量用于研究 關(guān)于 16-E2-16/Hb 相互作用的定性信息 空氣/水界面。 圖 1 顯示了 16-E2-16 分布的表面張力與對(duì)數(shù)濃度在不存在和 在不同溫度下存在 Hb (5 μM)。 斷點(diǎn) 表面張力與表面活性劑濃度對(duì)數(shù)的關(guān)系 不同溫度下純表面活性劑的文件對(duì)應(yīng) 到相應(yīng)溫度下表面活性劑的 cmc。 這 16-E2-16/Hb體系的表面張力曲線呈現(xiàn)兩個(gè)斷裂 點(diǎn),第一個(gè)斷點(diǎn)對(duì)應(yīng)臨界聚合 濃度(cac)代表表面活性劑的開始 蛋白質(zhì)結(jié)合而作為第二個(gè)斷點(diǎn)對(duì)應(yīng)于 在 Hb 存在下 16-E2-16 的 cmc。 16-E2-16 的 cmc 在不同溫度下不存在和存在 Hb 的情況下 列在表 1 中。從這些值可以看出,16-E2-16 的 cmc 隨著 Hb 的存在和溫度升高而增加。 在 Hb 存在下 cmc 的增加證實(shí)了 16-E2-16/Hb 復(fù)合物的形成,在此期間一些單體 與 Hb 結(jié)合,因此無法形成膠束 進(jìn)而導(dǎo)致膠束化延遲 [54]。 表1還 表明 cmc 值隨溫度升高而增加 這意味著疏水力的參與,它們是 溫度依賴,在 cmc 的蛋白質(zhì)表面活性劑相互作用中。 這可以歸因于 16-E2-的溶解度增加 16 單體隨溫度變化而抑制膠束化。 此外,較高的溫度有利于熱運(yùn)動(dòng),這會(huì)導(dǎo)致 更多的分子與 Hb 結(jié)合。 但是,cac 保持不變 在所有溫度下。 因此,我們可以認(rèn)為 16-E2-16 與 Hb 結(jié)合 通過 cac 附近的靜電相互作用,因?yàn)殪o電 相互作用不受溫度影響。 此后,作為 表面活性劑濃度增加,蛋白質(zhì)通過疏水力與表面活性劑相互作用。 下表面張力值 Hb-16-E2-16系統(tǒng)比對(duì)應(yīng)的16-E2-16系統(tǒng)是 由于 Hb 的高表面活性。

圖 1. 16-E2-16/Hb 在不同溫度下的表面張力。 (a) 298.15K (b) 308.15K (c) 318.15K。 [Hb] = 5 μM。


3.1.1. 界面參數(shù)


最大表面過量 (∫max) 表示為每單位面積界面處的表面活性劑分子濃度。 表面張力數(shù)據(jù)用于計(jì)算表面過量 應(yīng)用吉布斯吸附等溫線的濃度 (∫max) 方程:



其中 γ 是表面活性劑濃度 C 下的平衡表面張力 (mNm?1),n 是每分子的粒子數(shù) 表面活性劑。 由于表面活性劑的解離導(dǎo)致三種物質(zhì)的形成,公式 1111 表示在低于 cmc 的恒定溫度下 γ 與 log[16-E2-16] 之間的曲線斜率。 ∫max 值允許計(jì)算 每個(gè)分子 Amin 的最小表面積(以 nm2 為單位) 方程:



表格1 不同溫度下 Hb 不存在和存在時(shí) 16-E2-16 的 cmc、∫max 和 Amin


其中 NA 是阿伏伽德羅數(shù)。 為 ∫max 獲得的數(shù)據(jù) 和 Amin 列于表 1。發(fā)現(xiàn) ∫max 值為 16- E2-16 隨溫度升高而降低,表明 系統(tǒng)涉及靜電和疏水相互作用[55]。 Amin 值隨溫度升高而增加 正如分子運(yùn)動(dòng)增加所預(yù)期的那樣 [56]。 ?cmc ,其定義為表面活性劑降低表面張力的有效性,測(cè)量為 cmc 處的表面壓力 [57],和 從關(guān)系計(jì)算:




其中γ o 和γ cmc 是指溶劑體系的表面張力 (水/水 + Hb) 和 cmc 值下溶液的表面張力。


3.1.2. 熱力學(xué)參數(shù)


離子表面活性劑在水溶液中膠束化的熱力學(xué)參數(shù)可以借助 以下方程使用質(zhì)量作用模型膠束化 [58]



其中αG0m、αH0m和αS0m是自由能、焓的變化 和膠束化熵,Xcmc 是 cmc 處的摩爾分?jǐn)?shù)。 這 從方程 (6-8) 獲得的值顯示在表 2 中。


表 2 膠束化的自由能 (αG0m)、熵 (αS0m) 和焓 (αH0m) 的變化以及自由能 (αG0) 的變化 ad) 不存在和存在時(shí) 16-E2-16 的吸附 不同溫度下的 Hb。

這 αG0m 在所有溫度下的負(fù)值表明容易 在所研究的條件下形成膠束。 此外, αG0m 的負(fù)值隨溫度升高而增大 這表明16-E2-16分子在高溫下脫水是膠束形成的主要因素。 這 膠束化 αH0m 的負(fù)值證實(shí)了放熱 過程的性質(zhì)。 獲得的 αS0m 值都是正的,表明系統(tǒng)在轉(zhuǎn)換后增加了隨機(jī)性 離子表面活性劑分子變成膠束。 換句話說,我們可以 說對(duì)表面活性劑的運(yùn)動(dòng)有較小的阻礙 分子存在于膠束中時(shí)。



標(biāo)準(zhǔn)吸附自由能,αG0 這個(gè)系統(tǒng)的廣告是 使用關(guān)系計(jì)算:



αG0 的值 由此獲得的 ad 列于表 2 中。 吸附熱力學(xué)參數(shù)αG0 廣告價(jià)值全是 負(fù)且比 αG0m 更負(fù),表明界面處的吸附與自由能的降低有關(guān) 系統(tǒng)的。 這可能是由于空間因子對(duì) 對(duì)膠束化的抑制作用大于對(duì)吸附作用的影響。


3.2. 紫外-可見研究


Hb 在其吸收光譜中顯示三個(gè)不同的峰。 這些 是; Trp 和 Tyr 殘基的苯基(273 nm), -樂隊(duì) (360 nm) 和卟啉-索雷帶 (404 nm,強(qiáng)烈允許 - * 電子躍遷)[59,60]。 這個(gè)樂隊(duì)起源于 血紅素基團(tuán),嵌入由 蛋白質(zhì)的骨架通過適當(dāng)?shù)恼郫B[61,62]。 變化 soret 吸收帶的位置和強(qiáng)度 提供有關(guān)蛋白質(zhì)在綴合過程中可能發(fā)生解折疊和變性的信息 [59,60,62,63]。 圖 2 顯示了 不存在和存在各種濃度的 Hb 的吸光度 16-E2-16。 添加 16-E2-16 顯示出顯著的 Soret 帶強(qiáng)度的光譜變化,但峰值位置保持不變。 16-E2-16 降低強(qiáng)度 soret 帶暗示 16-E2-16 可以訪問血紅素組 并直接參與擾亂結(jié)構(gòu)和暴露 水介質(zhì)中的血紅素基團(tuán) [61]。 換句話說我們 可以說,由于蛋白質(zhì)的血紅素基團(tuán)與 16-E2-16 的某種相互作用,Hb 經(jīng)歷了擾動(dòng)。 血紅蛋白是 由于工作 pH 值 (7.4) 較大,因此帶輕微負(fù)電荷 比 Hb 的 pI (6.86) 和在這種情況下陽離子的相互作用 表面活性劑與蛋白質(zhì)同時(shí)具有靜電和疏水性 [64] 然而,這與表面張力結(jié)果非常吻合,van 德瓦爾斯力不容忽視。



圖 2. 不存在和存在 16-E2-16 時(shí) Hb (5 μM) 的紫外-可見光譜。 這 16-E2-16 (am) 的濃度為 0, 0.39, 0.76, 1.13, 1.48, 1.81, 2.14, 2.45, 2.75, 3.05 和 3.33 μM。


3.3. 熒光光譜研究


Hb 的熒光主要是由于色氨酸和酪氨酸殘基的存在。 圖 3 顯示了熒光光譜 Hb 不存在和存在 16-E2-16。 每個(gè) α 和 ˇ 鏈中有 3 個(gè)色氨酸(α214Trp、β215Trp、β217Trp)。 根據(jù) Rodgers 的說法,[65] Hb 的內(nèi)部熒光主要是 來源于 β237Trp。 由于 Trp 和血紅素都位于 在 Hb 的疏水腔中,有效的能量轉(zhuǎn)移來自 Trp 到血紅素顯著淬滅蛋白質(zhì)熒光 [66] 因此,水中 Hb 的熒光強(qiáng)度非常低。 當(dāng)用不同量滴定固定量的 Hb 時(shí) 在 16-E2-16 中,Hb 熒光強(qiáng)度的增加是 觀察到(圖 3)表明表面活性劑分子滲透 Hb 的疏水腔并暴露血紅素,從而 用血紅素抑制 Trp 猝滅,從而抑制熒光 Hb 強(qiáng)度明顯增加。 最初,熒光 強(qiáng)度迅速增加,但當(dāng) 16-E2-16 的濃度 超過它的cmc,熒光強(qiáng)度緩慢增加 此后。 對(duì)這一觀察結(jié)果的合理解釋是 疏水腔中疏水血紅素的溶解 表面活性劑膠束增加血紅素之間的距離 和 trp 并以這種方式抑制了 Trp 之間的能量轉(zhuǎn)移 和血紅素。

圖 3. 不存在和存在 16-E2-16 時(shí) Hb (5 μM) 的熒光光譜。 這 16-E2-16 (ak) 的濃度為 0, 0.39, 0.76, 1.13, 1.48, 1.81, 2.14, 2.45, 2.75, 3.05 和 3.33 μM。


圖 4 為 Hb 的同步熒光光譜 16-E2-16 在水體系中,μ = 20 nm(圖 4a)和 γ? = 80 nm(圖 4b)。 當(dāng) μ= 20 nm 時(shí),特征信息 關(guān)于Tyr,當(dāng)γμ= 80 nm 時(shí),獲得關(guān)于Trp 的特征信息[67]。 從圖中可以看出 Tyr 和 Trp 的熒光強(qiáng)度增加,熒光發(fā)射波長(zhǎng)幾乎保持不變 添加 16-E2-16。 從圖 4(a 和 b)可以看出,Trp 的熒光強(qiáng)度增加大于 Tyr。 因此,Trp 熒光可以代表 Hb 熒光 16-E2-16/H2O 系統(tǒng)。

圖 4. Hb (5 μM) 的同步熒光光譜。 (a) α∫= 20 nm (b) ? = 80 納米。 16-E2-16(ah)的濃度分別為0、0.39、0.76、1.13、1.48、1.81、 2.14 和 2.45,μM。


3.4. 圓二色性


進(jìn)行CD以進(jìn)一步確認(rèn)構(gòu)象變化 由 16-E2-16 引起的 Hb,從而允許進(jìn)一步評(píng)估 Hb 和 16-E2-16 之間的相互作用。 圖 5 顯示了 不存在和存在 16-E2-16 時(shí) Hb 的 CD 光譜。 光盤 Hb 的光譜在 208 nm 和 222 nm 處顯示兩個(gè)負(fù)最小值, 蛋白質(zhì)α-螺旋結(jié)構(gòu)的特征。 16-E2-16 光學(xué)不活動(dòng)不顯示任何信號(hào)。 在場(chǎng) 在 16-E2-16 中,Hb 的負(fù)橢圓度降低,表明 可能形成 Hb/16-E2-16 復(fù)合物 [68]。 α-螺旋 計(jì)算了 Hb 及其與 16-E2-16 (2 μM) 復(fù)合物的百分比,發(fā)現(xiàn)分別為 53% 和 47%。 進(jìn)一步降低 在更高濃度的 16-E2-16 (2.5 μM) 存在下達(dá)到 44% 表明 Hb 的 α-螺旋含量明顯降低。 因此, CD 結(jié)果表明存在 16-E2-16 變化 Hb 的二級(jí)結(jié)構(gòu)與我們的 計(jì)算結(jié)果。

圖 5. 不存在和存在 16-E2-16 時(shí) Hb (5 μM) 的 CD 光譜。


3.5. 分子對(duì)接


Hb 中的 α 和 β 鏈具有相似的結(jié)構(gòu)折疊, 由七個(gè)連續(xù)的α-螺旋和兩條鏈組成 包含由螺旋 4 和 5 包圍的間隙結(jié)合袋,而空腔的底部由 C 端部分形成 螺旋 6 和螺旋 7 的 N 端片段 [69]。 16-E2-16為主 Hb 與中央空腔、α1 和 β2 鏈結(jié)合(圖 6A)。 這 該結(jié)合位點(diǎn)上的氨基酸殘基包括 Thr39, α1 中的 Tyr42、Phe43、Pro44、His45、His58、His87、Leu91、Val93、Asn97 鏈和 Leu31、Arg40、Phe41、Phe42、His63、Val67、Ala70、Phe71、 His92, Leu96, His 97, Val98, Asn102, Phe103, Leu106, Leu141 in β2 鏈圖 6B。 有超過 20 個(gè)氨基酸殘基位于 16-E2-16 的站點(diǎn),這意味著它們之間的強(qiáng)相互作用 16-E2-16 和 Hb [70]。 疏水性和靜電力作用 在 16-E2-16 與 Hb 的結(jié)合中起重要作用,這個(gè)結(jié)果是 與我們的實(shí)驗(yàn)結(jié)果一致。 然而,范德瓦爾斯 力量不容忽視。 已觀察到一個(gè)氫鍵 在 16-E2-16/Hb 相互作用中的 16-E2-O 原子 具有 β2 鏈 ARG40 的 16 個(gè)分子(圖 6C)。 的形成 氫鍵穩(wěn)定 16-E2-16/Hb 復(fù)合物。 的類型 相互作用和參與相互作用的氨基酸殘基 以表格形式顯示(表 3)。


表3 結(jié)合能、結(jié)合常數(shù)和活性位點(diǎn)殘基及其與配體的相互作用類型。


圖 6. 具有 16-E2-16 的 Hb 結(jié)構(gòu)示意圖。 (A) Hb-16-E2-16 的結(jié)構(gòu)。 Hb 的亞單位用不同的顏色表示。 配體 16-E2-16 是 以棍子為代表。 (B) 距??康?16-E2-16(綠色)5? 范圍內(nèi) Hb 的周圍氨基酸殘基(橙色)。 (C) Hb/16-E2-16 相互作用的二維表示。 (為了 對(duì)圖例中顏色參考的解釋,讀者可參考本文的網(wǎng)絡(luò)版本。)


3.6. 分子動(dòng)力學(xué)模擬


進(jìn)一步研究16-E2-16的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性影響 結(jié)合Hb,采用分子動(dòng)力學(xué)模擬。 我們分析了兩者的動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)特性,例如均方根偏差 (RMSD) 和回轉(zhuǎn)半徑 (Rg)。 未綁定和 16-E2-16 有界 Hb 使用從獲得的軌跡 MD模擬。


為了探索 Hb 的穩(wěn)定性和動(dòng)力學(xué)特性 綁定后,未綁定和16-E2-16有界的MD模擬 Hb 是針對(duì) 20000 ps 的模擬時(shí)間尺度進(jìn)行的。 圖 7(A) 顯示未結(jié)合和 16-E2-16 的 RMSD 值 有界 Hb 復(fù)合物從 0 ps 突然增加到 6000 ps 并且 此后兩個(gè)系統(tǒng)都達(dá)到平衡相并獲得 在整個(gè)仿真過程中,RMSD 值穩(wěn)定,波動(dòng)小。 未結(jié)合和 16-E2-16 有界 Hb 的 RMSD 值 分別為 0.38 ± 0.02 和 0.34 ± 0.01 nm,在 最后 10000 ps 軌跡。 因此,很明顯 16-E2-的 RMSD 值 16 有界 Hb 小于未結(jié)合 Hb。 這一結(jié)果表明 16-結(jié)合后的結(jié)構(gòu)變化和復(fù)合物形成 E2-16 與 Hb 顯示出與我們的 UV-vis 的良好一致性 結(jié)果 [71]。

圖 7. (A) RMSD 和 (B) Rg 隨未結(jié)合和 16-E2-16 有界 Hb 的模擬時(shí)間的變化。


Rg 值給出了整體結(jié)構(gòu)的精細(xì)測(cè)量 Hb 的維度。 未結(jié)合和 16-E2-16 有界 Hb 在模擬 20000 ps 時(shí)間尺度上計(jì)算的 Rg 值 如圖7(B)所示。 該圖清楚地表明,最初未結(jié)合的和 16-E2-16 有界的 Hb 具有相同的 Rg 值 (2.34 nm) 并在 4000 ps 左右達(dá)到平衡,此后為 Rg 值在整個(gè)模擬期間保持穩(wěn)定,波動(dòng)很小。 該 Rg 值與報(bào)告的 Hb 的 Rg 值相似 (2.37 ± 0.05 nm) 通過中子散射技術(shù)測(cè)量 水溶液[72-75],因此表明模擬結(jié)果的準(zhǔn)確性。 達(dá)到平衡后,未結(jié)合的 Rg 值和 發(fā)現(xiàn) 16-E2-16 有界 Hb 為 2.22 ± 0.02 和 2.21 ± 0.02 分別在整個(gè)模擬過程中波動(dòng)很小。 從 6000 到 12000 ps,16-E2-16 結(jié)合 Hb 的 Rg 值有 略有增加,而從 14000 到 20000 ps,Rg 值減少 關(guān)于未結(jié)合的 Hb。 Rg 值的這種變化表明 16- E2-16 在 Hb 中引起了一點(diǎn)構(gòu)象變化 [68],這 與實(shí)驗(yàn)結(jié)果相似,與CD吻合良好 結(jié)果。



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